|
|
Návrh vícejádrového procesoru ve VHDL
Novotný, Jaroslav ; Straka, Martin (oponent) ; Kaštil, Jan (vedoucí práce)
V rámci práce byl navrhnut a v jazyce VHDL implementován jednoduchý multiprocesor podporující paralelní zpracování programové úlohy. Byla navržena a realizována universální transparentní generická propojovací vrstva určená k připojení libovolného počtu procesorových jader ke sdílenému adresovému prostoru pomocí arbitrované sběrnice. Každému z jader je v rámci vrstvy přidělena vyrovnávací paměť volitelných vlastností. V systému je řešen problém paměťové koherence pomocí protokolu MSI. Dále je dána k dispozici přímá i nepřímá podpora synchronizace. Za účelem ověření činnosti bylo navrženo a realizováno jednoduché procesorové jádro jehož kopie byly spojeny propojovací vrstvou. Funkčnost systému byla ověřena na testovacích úlohách, přičemž bylo prokázáno zrychlení. Celý systém byl odzkoušen na čipu Virtex6.
|
|
|
Emulace paměťových subsystémů v multiprocesorovém prostředí
Rajčok, Andrej ; Husár, Adam (oponent) ; Přikryl, Zdeněk (vedoucí práce)
Táto práce rozebíra problém návrhu emulačné platformy pro mutiprocesorové systémy so sdílenou paměťí. V tejto práci je řešený problém multiprocesorove komunikace, rozebírají se různé komunikační systémy používané na komunikáci medzi procesormi a protokoly zajišťujícího koherenci dat. Jedno z řešenní je vybraté a je vypracován návrh a implementace do integrovaného vývojového prostredí. Na konci se analyzuje vytvořen emulačný systém s ohledem na jeho vlastnosti jako rýchlost a paměťová náročnost.
|
|
|
Údržba malého dopravního letounu s využitím metodiky MSG-3
Trefilová, Helena ; Třetina, Karel (oponent) ; Finda, Jindřich (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá problematikou údržby malého dopravního letounu s využitím metodiky MSG-3 a vytvořením jeho údržbového plánu. Zaměřuje se zejména na údržbu systémů a pohonných jednotek. Metodika je aplikována na letoun L-410UVP-E20. Součástí práce je zhodnocení stavu v oblasti údržby letadel, používané přístupy, metody a předpisy. Poslední část práce je praktická ukázka aplikace metody MSG-3 na zadaných agregátech a její následné vyhodnocení.
|
|
|
Využití metod hmotnostní spektrometrie v identifikaci a lokalizaci významných molekul parazitických helmintů
Siegel, Tomáš ; Kašný, Martin (vedoucí práce) ; Harant, Karel (oponent)
Tato práce shrnuje základní technologická řešení, postupy a principy hmotnostní spektrometrie a zaměřuje se na její využití v oblasti parazitologie. V první části jsou postupně definovány jednotlivé fáze zpracování biologického vzorku s využitím hmotnostní spektrometrie - od ionizace až po způsoby vyhodnocování výsledků. Různé postupy jsou prezentovány především na příkladech publikací zabývajících se využitím hmotnostní spektrometrie při identifikaci molekul parazitických helmintů, se zaměřením na proteiny a fasciolidní motolice (např. Fasciola hepatica). Druhá část práce se věnuje identifikaci a lokalizaci molekul pomocí zobrazovací hmotnostní spektrometrie a využití této techniky v experimentální biologii, parazitologii. V závěru práce je navržen aplikovatelný postup pro identifikaci a lokalizaci významných proteinů motolice Fascioloides magna s využitím kombinace techniky mikrodisekce a hmotnostní spektrometrie.
|
|
|
Využití DESI/DAPPI-MS a MALDI-MS pro studium biologických objektů
Kaftan, Filip
(ČJ) Předkládaná disertační práce byla cílena na využití desorpčně ionizačních technik hmotnostní spektrometrie ke studiu různorodých biologických vzorků. Nedílnou součástí této práce byla konstrukce univerzální platformy pro ambientní ionizační techniky (AIT) v hmotnostní spektrometrii (MS) určené pro experimenty prováděné ve spojení s desorpční elektrosprejovou ionizací (DESI) a desorpční fotoionizaci za atmosférického tlaku (DAPPI). V rámci vývoje byla původně manuální platforma pro AIT přestavěna na motorizovanou platformu softwarově ovládanou prostřednictvím uživatelského rozhraní hmotnostního spektrometru. Díky motorizované platformě tak bylo možné s definovanou velikostí kroku provádět jednorozměrné (1-D) a dvourozměrné (2-D) analýzy vzorků. Zkonstruovaná platforma pro AIT v MS byla testována v případě DESI-MS režimu prostřednictvím modelového analytu rhodaminu B a pomocí reálných biologických vzorků v podobě vzorků rostliny oměj šalamounek. Testování platformy s využitím techniky DAPPI-MS bylo provedeno na biologických vzorcích novorozeneckého mázku. Modelového analytu rhodaminu B bylo v rámci techniky DESI-MS využito ke studiu základních desorpčně ionizačních procesů, ke kterým v DESI během analýzy vzorků dochází. K experimentům, které byly konkrétně zaměřené na vznik a charakter...
|
|
| |
|
|
Využití metod hmotnostní spektrometrie v identifikaci a lokalizaci významných molekul parazitických helmintů
Siegel, Tomáš ; Kašný, Martin (vedoucí práce) ; Harant, Karel (oponent)
Tato práce shrnuje základní technologická řešení, postupy a principy hmotnostní spektrometrie a zaměřuje se na její využití v oblasti parazitologie. V první části jsou postupně definovány jednotlivé fáze zpracování biologického vzorku s využitím hmotnostní spektrometrie - od ionizace až po způsoby vyhodnocování výsledků. Různé postupy jsou prezentovány především na příkladech publikací zabývajících se využitím hmotnostní spektrometrie při identifikaci molekul parazitických helmintů, se zaměřením na proteiny a fasciolidní motolice (např. Fasciola hepatica). Druhá část práce se věnuje identifikaci a lokalizaci molekul pomocí zobrazovací hmotnostní spektrometrie a využití této techniky v experimentální biologii, parazitologii. V závěru práce je navržen aplikovatelný postup pro identifikaci a lokalizaci významných proteinů motolice Fascioloides magna s využitím kombinace techniky mikrodisekce a hmotnostní spektrometrie.
|
|
|
Využití DESI/DAPPI-MS a MALDI-MS pro studium biologických objektů
Kaftan, Filip ; Cvačka, Josef (vedoucí práce) ; Valterová, Irena (oponent) ; Preisler, Jan (oponent)
(ČJ) Předkládaná disertační práce byla cílena na využití desorpčně ionizačních technik hmotnostní spektrometrie ke studiu různorodých biologických vzorků. Nedílnou součástí této práce byla konstrukce univerzální platformy pro ambientní ionizační techniky (AIT) v hmotnostní spektrometrii (MS) určené pro experimenty prováděné ve spojení s desorpční elektrosprejovou ionizací (DESI) a desorpční fotoionizaci za atmosférického tlaku (DAPPI). V rámci vývoje byla původně manuální platforma pro AIT přestavěna na motorizovanou platformu softwarově ovládanou prostřednictvím uživatelského rozhraní hmotnostního spektrometru. Díky motorizované platformě tak bylo možné s definovanou velikostí kroku provádět jednorozměrné (1-D) a dvourozměrné (2-D) analýzy vzorků. Zkonstruovaná platforma pro AIT v MS byla testována v případě DESI-MS režimu prostřednictvím modelového analytu rhodaminu B a pomocí reálných biologických vzorků v podobě vzorků rostliny oměj šalamounek. Testování platformy s využitím techniky DAPPI-MS bylo provedeno na biologických vzorcích novorozeneckého mázku. Modelového analytu rhodaminu B bylo v rámci techniky DESI-MS využito ke studiu základních desorpčně ionizačních procesů, ke kterým v DESI během analýzy vzorků dochází. K experimentům, které byly konkrétně zaměřené na vznik a charakter...
|
|
|
Využití DESI/DAPPI-MS a MALDI-MS pro studium biologických objektů
Kaftan, Filip
(ČJ) Předkládaná disertační práce byla cílena na využití desorpčně ionizačních technik hmotnostní spektrometrie ke studiu různorodých biologických vzorků. Nedílnou součástí této práce byla konstrukce univerzální platformy pro ambientní ionizační techniky (AIT) v hmotnostní spektrometrii (MS) určené pro experimenty prováděné ve spojení s desorpční elektrosprejovou ionizací (DESI) a desorpční fotoionizaci za atmosférického tlaku (DAPPI). V rámci vývoje byla původně manuální platforma pro AIT přestavěna na motorizovanou platformu softwarově ovládanou prostřednictvím uživatelského rozhraní hmotnostního spektrometru. Díky motorizované platformě tak bylo možné s definovanou velikostí kroku provádět jednorozměrné (1-D) a dvourozměrné (2-D) analýzy vzorků. Zkonstruovaná platforma pro AIT v MS byla testována v případě DESI-MS režimu prostřednictvím modelového analytu rhodaminu B a pomocí reálných biologických vzorků v podobě vzorků rostliny oměj šalamounek. Testování platformy s využitím techniky DAPPI-MS bylo provedeno na biologických vzorcích novorozeneckého mázku. Modelového analytu rhodaminu B bylo v rámci techniky DESI-MS využito ke studiu základních desorpčně ionizačních procesů, ke kterým v DESI během analýzy vzorků dochází. K experimentům, které byly konkrétně zaměřené na vznik a charakter...
|
|
|
Patologická diagnostika Lynchova syndromu
KRAUSOVÁ, Lenka
Lynchův syndrom je autozomálně dominantně dědičné onemocnění vytvářející predispozici ke vzniku kolorektálního karcinomu. Podle literatury až 5 % kolorektálních karcinomů může být asociováno s Lynchovým syndromem. Vzhledem k familiárnímu výskytu je jeho záchyt důležitý kvůli včasné prevenci v rodině. Depistáž je dnes založena na metodách moderní patologie. V teoretické části této práce je nejprve popsána stavba trávicí trubice, definice a historie Lynchova syndromu, a nakonec i metodika jeho depistáže v laboratoři patologie. Depistáž může být založena na hodnocení mikroskopických znaků nádoru (Semi PREDICT skóre) v histologických řezech, na imunohistochemickém vyšetření MMR (mismatch repair) proteinů, anebo na molekulárně genetickém stanovení MSI (nestability mikrosatelitů). Zejména korelaci prvních dvou metod je věnována praktická část. Náhodným výběrem byly sestaveny dvě skupiny případů kolorektálního karcinomu. První skupina sestávala z 25 případů se zachovanou imunoexpresí MMR proteinů, druhá skupina z 25 případů se ztrátou exprese alespoň jednoho MMR proteinu. Výsledky byly dále ověřeny molekulárně genetickým průkazem MSI a pro odlišení sporadických forem také analýzou genu BRAF a hypermetylace promotoru MLH1. V suspektních případech byly dále vyšetřeny germinální mutace MMR genů, které potvrdily Lynchův syndrom u 5 případů z druhé skupiny. Senzitivita Semi PREDICT skóre pro predikci MMR-deficience (a nepřímo tak pro detekci Lynchova syndromu) byla 84 %, specificita 48 %. Senzitivita molekulárně genetického stanovení MSI 87 %, po vztažení na pacienty s Lynchovým syndromem pouze 50 %, specificita 100 %. Tato práce prokázala dominantní postavení imunohistochemického vyšetření exprese MMR proteinů v diagnostice MSI-H karcinomů, která je v současné době základem depistáže Lynchova syndromu.
|
host ::
RSS.